No Brasil, o El Niño traz condições climáticas específicas para cada região (Figura 4). Nas regiões Norte e Nordeste ocorre o aumento na seca, tornando maiores os riscos de incêndios florestais e crises hídricas. Enquanto no Sul, ocorrem chuvas persistentes na primavera e chuvas intensas no outono, com o aumento da temperatura média. No Sudeste, as temperaturas tendem a ficar acima da média durante o El Niño. No sul do Mato Grosso do Sul, também há evidências de chuva e temperatura acima da média. Durante o La Niña, esses padrões se invertem. O Norte e Nordeste têm o aumento nas chuvas e vazões, enquanto o Sul enfrenta chuvas escassas (GRIMM; TEDESCHI, 2009).  Entretanto, em cada evento de La Niña ou El Niño, os padrões de distribuição de chuvas podem ser diferentes, o que ocorre devido à combinação com condições atmosféricas e oceânicas do período, como, por exemplo, as condições de temperatura do Oceano Atlântico.